深挖保守序列,他們“海選”出生物鐘“發(fā)條” 

2025-05-16 19:03:22 來源: 科技日報 點(diǎn)擊數(shù):

科技日報記者 張佳星

2017年諾貝爾生理或醫(yī)學(xué)獎獲獎?wù)咴诠夡w內(nèi)分離出一個控制日常生物節(jié)律(生物鐘)的基因,這種機(jī)制也影響著人類。

5月12日,國際期刊《公共科學(xué)圖書館生物學(xué)》(PLOS Biology)刊載了我國學(xué)者在這一領(lǐng)域的推進(jìn)式研究。華中科技大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院張珞穎團(tuán)隊聯(lián)合北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院陸劍團(tuán)隊在RNA翻譯水平發(fā)現(xiàn)了一種“節(jié)律調(diào)速器”,能夠控制生物鐘。與以往聚焦基因轉(zhuǎn)錄層面機(jī)制的研究相比,該成果在RNA翻譯水平揭示了節(jié)律調(diào)控的新機(jī)制,進(jìn)一步拓展了對生物鐘調(diào)控體系的理解。

更深一步研究

“基因需要通過兩步走,影響生命活動,第一步是DNA轉(zhuǎn)錄為RNA,第二步是mRNA翻譯為蛋白質(zhì)。”論文通訊作者之一、北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授陸劍告訴科技日報記者,晝夜節(jié)律核心機(jī)制的轉(zhuǎn)錄調(diào)控已被廣泛研究。但如果第二步?jīng)]走通,調(diào)節(jié)也不會完成。

學(xué)術(shù)研究中已經(jīng)有越來越多的證據(jù)表明,第二步的翻譯調(diào)控是維持生物鐘準(zhǔn)確性與適應(yīng)性的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。

由于RNA更加變化多樣,其調(diào)控研究相較于DNA轉(zhuǎn)錄過程更加困難?!拔覀兎治隽舜罅坎煌墓壩锓N,找到了高度保守的mRNA上游開放閱讀框(uORF)。”陸劍解釋,高度保守意味著它在物種進(jìn)化演變過程中功能保守且十分重要,節(jié)律的控制也符合這一規(guī)律。

更神奇的是,團(tuán)隊研究發(fā)現(xiàn),果蠅的節(jié)律相關(guān)基因中顯著富集上游開放閱讀框的現(xiàn)象,在人類中也存在。

“大量開放閱讀框序列,一般被認(rèn)為其具有動態(tài)、特異的翻譯抑制作用,且大多數(shù)保守性較差?!鼻迦A大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授楊雪瑞點(diǎn)評認(rèn)為,研究團(tuán)隊找準(zhǔn)了“保守”這一切入點(diǎn),進(jìn)行海量細(xì)致的研究,通過一系列巧妙設(shè)計的實(shí)驗(yàn),最終“海選”出了關(guān)鍵的核心控制“元件”。

揭示具體機(jī)制

研究團(tuán)隊使用基因編輯技術(shù)刪除了果蠅的時鐘(CLOCK)基因開放閱讀框,發(fā)現(xiàn)這些果蠅體內(nèi)的時鐘蛋白在白天被過度積累。

論文通訊作者之一、華中科技大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院教授張珞穎解釋,這表明“節(jié)律調(diào)速器”在白天抑制時鐘蛋白的翻譯,延緩生物鐘的“節(jié)拍”,確保生物體遵循地球自轉(zhuǎn)的周期,順應(yīng)24小時的晝夜更替。

那些被刪除了“節(jié)律調(diào)速器”的果蠅表現(xiàn)出了節(jié)律周期縮短的“快時鐘”表型,在模擬季節(jié)變換的實(shí)驗(yàn)中它們睡眠調(diào)節(jié)的能力也明顯減弱,這些都證明了團(tuán)隊發(fā)現(xiàn)的特定序列的開放閱讀框起著時鐘“發(fā)條”的作用。

團(tuán)隊還對敲掉基因的果蠅進(jìn)行了系統(tǒng)的轉(zhuǎn)錄組研究?!拔覀円馔獍l(fā)現(xiàn),它在其他的生理通路中也扮演著重要的‘角色’?!标憚φf,例如產(chǎn)卵量與后代數(shù)量比正常果蠅減少,抗饑餓能力下降等。

“開放閱讀框的翻譯調(diào)控的生理影響超越了節(jié)律與睡眠,深入?yún)⑴c多層級生理穩(wěn)態(tài)的維系。它不再是一個簡單的翻譯‘開關(guān)’,而是機(jī)體適應(yīng)環(huán)境變化,為了在不改變基因轉(zhuǎn)錄水平情況下調(diào)控蛋白而合成的精密模塊。”張珞穎說。

可見,這段短短十幾個堿基的序列是生命活動中的關(guān)鍵“元件”。蘇州大學(xué)劍橋-蘇大基因組資源中心教授張勇認(rèn)為,這項(xiàng)研究引發(fā)出了廣闊的思考,哺乳動物中的開放閱讀框在生物鐘基因中是否起著同樣的作用,進(jìn)一步的探索或可為睡眠障礙、時差綜合征提供新的治療靶點(diǎn)。

(論文截圖)

責(zé)任編輯:李夢一

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